داستان این فیلم به چگونگی رخ دادن جنگ اصلی بین انسان‌ها و ماشین‌ها و پیدایش ماتریکس میپردازد و…

سال 2565. اشباحی فضایی با شهاب سنگی به زمین آمده اند و آن را تسخیر کرده اند. انسان ها به شهرهایی عقب رانده شده اند و «دکتر آکی راس»، دانشمندی که یکی از همان جانوران شبح گونه زخمی مرگبار به او زده، در جست و جوی اطلاعاتی در باب هدف و فیزیولوژی این موجودات است...

«سام ویتوسکی» اکنون اتوبوت ها را به حال خود رها کرده و تصمیم گرفته یک زندگی معمولی داشته باشد. اما زمانی که ذهنش با علائم مرموزی پر می شود، «دسپتیکون» ها به دنبال او می افتند، و او بار دیگر به نبرد تبدیل شوندگان باز می گردد.

یک ستاره سینما از یک خدمتکار پارکینگ در رستورانی در بورلی هیلز دعوت می کند تا به عنوان معشوقه خود ظاهر شود تا رابطه اش با یک مرد متاهل را پوشش دهد.

داستان درباره جوانی است که رفیقش توسط «مافیای بلغار» کشته می‌شود و او به همین دلیل به پاریس فرار می‌کند. اما پس از سه سال یک چهره آشنا را مجددا می‌بیند…