در پایان زمام داری و دوران مالکین بزرگ ، یکی از آخرین سامورایی های باقیمانده ی ژاپن ، سیزده نفر از شمشیر زنان و جنگجویان ماهر را گرد یکدیگر می آورد تا با کمک هم به نبرد با شوگان بروند ، شوگان یکی از قدرتمندان صاحب نفوذ است که با استفاده از قدرت و ثروت خویش در حال ظلم به مردم و کشتار و بردگی کشیدن از آنها است و نقشه دارد تا کشور را در دست بگیرد و حالا سامورایی جوان و گروه اش برای کشتن او پیمان بسته اند و…

در ژاپن قرن نوزدهم، یک شمشیر زن چیره دست، دختری به نام آزومی و گروهی از یتیم های دیگر را به قاتلی تبدیل می کند که ماموریتشان از بین بردن جنگ سالاران متخاصم است. هنگامی که یکی از این فرماندهان جنگ دستور نابودی قاتلان جوان را می دهد، قاتل ترسناکی به نام بیجومارو را برای انجام وظیفه آزاد می کند. در حالی که آزومی و رفقایش برای بقا می جنگند، نبرد وحشتناکی در جریان است.

سه سال پس از شکست آخرین برنامه ،در طی یک برنامه دوم عملیاتی ساختگی ،گروهی از دانش آموزان به یک جزیره فرستاده شدند ، فقط با یک هدف، کشتن تروریست بین المللی " شویا ناناهارا"