دختری ۱۰ ساله در نقل مکان خانواده‌اش به حومه شهر، در دنیایی سرگردان می شود که توسط خدایان، جادوگرها، و هیولاها اداره میشود؛ جایی که انسان‌ها به شکل حیوانات در می آیند.

موضوع فیلم درباره اثرات مخرب جنگ و تاثیر ویرانگر آن بر روی عواطف و احساسات مردم است. در داستان جنگ بزرگی اتفاق می افتد، و پادشاه از تمامی جادوگران می خواهد تا در این جنگ او را همراهی کنند. اما جادوگری به نام هاول از این امر امتناع می‌کند و به مبارزه با بمب افکن‌های جنگی بر می‌آید. در این میان دختری که او را دوست دارد سعی در باطل کردن طلسم هاول دارد که همان قلب هاول است و…

یک شمشیرزن راهی سفر می شود و با اکراه پسری ژنده پوش و سگش را به یک معبد دورافتاده بودایی می برد. با این حال، او در طول ماجراجویی آنها با درگیری های اخلاقی زیادی روبرو می شود.

در جریان یک ممنوعیت ایجاد شده برای رفتن به سطح آب دریا و تماشا دنیای بیرون، یک ماهی با پسری به نام «سوسوکی» ملاقات می‌کند و خیلی زود توسط وی اسم «پنیو» برای این ماهی انتخاب می‌شود. «پونیو» شدیدا علاقه دارد تا به یک انسان تبدیل شود و...

داستان حول محور یک دانشجو به نام تسونئو و یک رویاپرداز به نام جوزه که زندگی‌اش رو روی یک ویلچر می‌گذراند، می‌چرخد. جوزه روزهایش را اغلب وقف مطالعه و نقاشی می‌کند تا این که با تسونئو برخورد میکند و تصمیم میگیرد که دیگر باید با دنیای واقعی رو به رو شود.