در این قسمت دکتر رباتنیک حالا برای کنار زدن سونیک و رسیدن به‌اهداف شوم خود، دست‌به‌دامن یکی از هم‌نوعان سونیک با اسم ناکلز با نقش‌آفرینی ادریس البا شده است.

یک پلیس ماجراجو به نام تام در شهری خوش آب و هوا در گرین هیلز به موجودی عجیب و غریب به نام سونیک برای فرار از دست افرادی خبیث که به دنبال او هستند کمک می‌کند و…