هنگامی که یک زیردریایی آمریکایی به طور مرموزی نابود می شود، همه شواهد حاکی از بازگشت گودزیلا است و یک روزنامه نگار تحقیقی تصمیم می گیرد تا ماجرا را پوشش دهد.

دایناسور ژاپنی از خواب بیدار می شود و به سمت توکیو شنا می کند و در پی نابودی هسته ای است.

هنگامی که یک دانشجوی کالج توکیو مورد حمله یک غول قرار می گیرد، او تبدیل به یک غول می شود که از گوشت انسان تغذیه می کند.

چند بیگانه‌ی فضایی با طرح نقشه‌ای می‌کوشند تا کره زمین را تسخیر کنند. آن‌ها دو هیولا با نام های "شاه گیدورا" و "گیگان" را به کار می‌گیرند که از یک مرکز مخفی روی زمین کنترل می‌شوند. حال نوبت آن رسیده تا گودزیلا با کمک دوستش "آنگاریوس" برای مقابله با آن ها وارد نبردی خطرناک شود...