مردان ایکس گرد هم آمده‌اند تا یک مامور جهش یافته که قصد جان رئیس جمهور را کرده است، را بیابند. در پی این حادثه، آکادمی انسان‌های جهش یافته مورد حمله ارتش قرار می گیرد.

پس از اینکه الیزابت دچار افسردگی می‌شود و چندین بار دچار مشکل می‌شود، یک پزشک برای او داروی پروزاک تجویز می‌کند که به او کمک می‌کند تا عقلش را بازیابد.