داستان موجودی پیشرفته به نام آریس از دنیای دیجیتال که به دنیای واقعی فرستاده می‌شود تا مأموریتی خطرناک را در جهانی آشفته و پر از تضاد بین انسان و ماشین انجام دهد. با ورود آریس به دنیای واقعی، خط میان واقعیت و دنیای مجازی کمرنگ می‌شود و سؤال‌هایی عمیق درباره انسانیت، آزادی و کنترل ذهن مطرح می‌گردد.

بعد از نابودی شبکه آسمان، گروهی از انسان‌های بازمانده به رهبری جان کانر سعی دارند مانع از اتمام کار توسط ماشین‌ها، شوند.