ماکوتو کونو دختر 17 ساله دبیرستانی که با خانواده اش در توکیو زندگی می کند پیغامی را بر روی تخته سیاه دبیرستان خود می خواند و بدون اطلاع با شی عجیبی شبیه به گردو برخورد می کند. اما به زودی متوجه می شود که او توانایی سفر در زمان را دارد...

بسیاری از مهندسان از سراسر جهان در تاسیسات دریایی اینترپل "پاسفیک بوی"، در جنوب دریای جنوب سواحل استان توکیو، گرد هم می آیند تا شاهد راه اندازی یک سیستم جدید باشند که تمام سیستم های دوربین مجری قانون را در سراسر جهان به هم متصل می کند و تشخیص چهره را امکان پذیر می کند. کونان به همراه دوستانش کوگورو، ران، آگاسا، هایبارا و پسران کارآگاه نیز با دعوت از سونوکو برای دیدن نهنگ ها راهی جزیره می شوند. او پیامی از سوبارو دریافت می کند که می گوید یک مامور یوروپل در آلمان توسط جین به قتل رسیده است. کانن که آشفته است، مخفیانه وارد کشتی پلیس به رهبری کورودا می شود که آنها را به جزیره می آورد تا از کار تکمیل محافظت کند، و در مرکز جدید بازدید می کند، درست در زمانی که سازمان سیاه پوست یک مهندس زن را می رباید و به دنبال بخشی از داده های مهم است. در درایو او صدای زوزه وحشتناک پیچ ها از اقیانوس شنیده می شود، زمانی که یک فرد ناشناس به هایبارا نزدیک می شود.

یک جاسوس به آژانس پلیس ملی ژاپن نفوذ کرد و اسناد طبقه‌بندی‌شده MI6، BND، سیا و FBI را به دست آورد. ری فورویا و تیم PSB توکیو، او را هنگام فرار دستگیر کردند و...

انفجار خط جدید متروی توکیو ، سبب می‌شود که کونان و دوستانش به سمت دهکده‌ای پوشیده از برف، سوق داده شوند. هشت سال از این اتفاق می‌گذرد و در این دهکده‌ی کوچک، کونان به دنبال سرنخ‌هایی از یک واقعه‌ی تکان دهنده می‌باشد. واقعه‌ای که سبب شد تا زنی به کام مرگ کشیده شود و یکی از اهالی وارد کما شود....

خلاصه داستان : سیصد سال بعد است و کارهای احمقانه‌ی بشر تعادل محیط زیست زمین را ویران کرده است و انسان‌ها در محاصره‌ی جنگل‌هایی زنده و هوشمند قرار گرفته‌اند. این روند، زمانی به هم می‌خورد که پسری جوان به نام «آگیتو» درون منطقه‌یی ممنوعه دستگاهی پیدا می‌کند که درون آن نور آبی عجیبی می‌درخشد. درون دستگاه، دختری به نام «تولا» که از گذشته آمده تحت مراقبت است. تولا «ماموریتی» دارد که از گذشته به او واگذار کرده‌اند…

این یک تلاقی بین سریال Lupine III و Case Closed است و بعد از سریال تلویزیونی ویژه Lupine the 3rd vs Detective Conan اتفاق می‌افتد و علاوه بر این عناصر مختلفی از سلف خود را در داستان خود گنجانده است. طرح ...

کارآگاه کونان: گلوله سرخ در این برنامه ژاپن بازی های جهانی ورزشی آینده را در توکیو جشن می گیرد.

کارآگاه کونان: گلوله سرخ در این برنامه ژاپن بازی های جهانی ورزشی آینده را در توکیو جشن می گیرد.

کارگاه کونان انفجاری که در روز افتتاحیه ی ریزورت و سالن همایش های بزرگ توکیو رخ میدهد را بررسی میکند