داستان فیلم در دهه ۱۹۵۰ در لس آنجلس اتفاق می افتد، روایت سه پلیس لس آنجلس که در گیر ماجرای قتلی در کافه نایت اوول می شوند. ماجرا به جرایم سازمان یافته، فحشا، مواد مخدر و فساد سیاسی گسترش می یابد. عنوان داستان، محرمانه، به مجله رسوایی بر می گردد که بصورت تخیلی در ۱۹۵۰ با عنوان هاش-هاش منتشر می شده.

فیلم با لحظات فرود آپولو 11 بر ماه آغاز می شد و روایت بر مبنای شخصیت جیم لاول، فضانورد معروف آمریکایی و فرمانده آپولو 13 شکل می گیریرد. داستان ضمن روایت زندگی خانوادگی آنها از یک سو و مشکلات عظیمی که در راه این ماموریت پشت سر گذاشتند، از سوی دیگر ادامه می یابد.

«جیمز ادواردز» (اسمیت)، پلیس نیویورکی، سر و شکلی ورزشکارانه و رفتاری بی توجه و سبک سرانه نسبت به اجرای قانون دارد. یک شب، پس از تعقیب بزه کار مرموزی که یک موجود ماورای زمینی از آب در می آید، «کی» (جونز)، یکی از مأموران کهنه کار سازمانی دولتی که سال هاست مخفیانه رفت و آمد موجودات فضایی را زیر نظر دارد، او را به هم کاری دعوت می کند...

"مالز مورگان" سارق جواهراتی است که دست به سرقت بزرگی می زند و الماس بزرگی را سرقت می کند.پس از دو سال که از زندان آزاد می شود متوجه می شود در جائی که دو سال پیش الماس را مخفی کرده اداره پلیس ساخته شده است و ...

جنگ جهانی دوم، پس از حمله ی ژاپنی ها به پرل هاربر. دو دوست دوران کودکی به نام های «ریف مکولی» (افلک) و «دنی واکر» (هارتنت)، زنی (بکینسیل) را که هر دو به او علاقه مند هستند پشت سر می گذراند و رهسپار انجام مأموریت بمباران توکیو می شوند.

خلاصه داستان : یک دکتر و همسرش، بعد از اینکه دخترشان توسط یک گروه ربوده می شود، و آن ها باید برای آزادی دخترشان که جانش در خطر جدی است، مبلغی را آماده کنند…

پس از اینکه پسر نه ساله ای که مبتلا به اوتیسم است کدی محرمانه را می شکند،"آرت جفریز" مامور اف بی آی مامروریت پیدا می کند او را در مقابل تروریستهایی که قصد کشتنش را دارند محافظت کند ...

«گابريل يولا» (لي) يکي از مأموران سابق آژانس کارآگاهي MVA سر به ياغي گري مي گذارد و با استفاده از تکنولوژي سفر کوانتومي، بين دنياهاي موازي سفر مي کند و خويشتن هاي موازي اش را به قتل مي رساند. او با هر قتلي قدرتي بيش از پيش کسب مي کند و حالا بايد به هر ترتيبي که شده جلويش گرفته شود...

هنگامی که دشمنان ''بوریس''، ''ناتاشا'' و رهبر ''بی باک'' به دنیای واقعی با یک طرح نابکارانه فرار کردند، ''راکی'' و ''بول وینکل'' همین کار را انجام داده و با یک مامور جوان اف بی آی همراه می شوند تا آن سه را متوقف کنند.